Se vstupem ČR do Evropské unie vznikla našemu státu povinnost vytvořit soustavu zvláště chráněných území neboli ptačích oblastí (Special Protection Areas = SPA), určených pro ochranu druhů, uvedených v příloze I Směrnice o ochraně volně žijících ptáků 79/409/EHS. V této směrnici jsou uvedeny druhy, které jsou ohrožené vyhynutím nebo citlivé vůči specifickým změnám na stanovišti, případně druhy s málo početnými populacemi, prostorově omezeným místním rozšířením nebo vyžadující zvláštní pozornost z důvodu specifického charakteru jejich stanoviště.

Návrhy ptačích oblastí připravila na základě daných ornitologických kritérií Česká společnost ornitologická ve spolupráci s Agenturou ochrany přírody a krajiny. Ptačí oblasti mají svou rozlohou a počtem zajistit stabilitu populací druhů, pro které jsou vyhlašovány. Chráněna jsou takto hnízdiště, zimoviště nebo shromaždiště, přičemž se zvýšená pozornost věnuje hlavně mokřadům. V zásadě se upřednostňují přirozená nebo polopřirozená stanoviště, která jsou ornitologickým významem nebo typem stanoviště odlišitelná od okolí.

Bylo navrženo 41 lokalit, které již všechny byly nařízením vlády vyhlášeny ptačími oblastmi. Většina navržených ptačích oblastí (38) byla v navrženém rozsahu vyhlášena v průběhu let 2004 a 2005. Návrh na vyhlášení další PO Heřmanský stav-Odra-Poolší byl zamítnut a PO byla ve zmenšeném rozsahu vyhlášena až k 1.6.2008. Zbývající dvě oblasti Českobudějovické rybníky a Dehtář se, z důvodu konfliktu s rybničním hospodařením, dočkaly vyhlášení až v říjnu 2009.

Faktory, které negativně ovlivňují druhy ptáků v ptačích oblastech, jsou zejména nevhodné způsoby zemědělství, obhospodařování lesů, hospodaření na rybnících a trvalých travních porostech, či myslivecké aktivity, které nejsou v souladu s ochranou uvedených druhů a také neusměrněné rekreační aktivity.

Pro ochranu uvedených ptačích druhů jsou v ptačích oblastech přijímána opatření, která mají zabránit lovu, nelegálnímu odchytu, vybírání hnízd, ničení současných i potenciálních hnízdišť, zimovišť a shromaždišť i úrazům na vedeních vysokého napětí.

V každé ptačí oblasti probíhá pravidelně monitoring druhů, pro které byla ptačí oblast vyhlášena. Pro každý tento druh byly připraveny metodiky monitoringu, pomocí nichž se zjišťují trendy vývoje populací sledovaných druhů. Pro sledování uvedených druhů se používají takové standardizované metody, jimiž nedochází k rušení ani k jinému zásahu do přirozeného vývoje ptáků. Stejně jako pro druhy, byly i pro každou ptačí oblast připraveny plány monitoringu, shrnující poznatky o vývoji populací předmětů ochrany dané ptačí oblasti, o ochranných podmínkách, které je třeba na jejím území dodržovat a o negativních faktorech, které v oblasti mohou na ptačí populace působit.

Souhrn doporučených opatření obsahuje základní identifikační a popisné údaje o ptačí oblasti, odborné a věcné zdůvodnění cílů a způsobů péče o předmět ochrany ptačí oblasti a rozpis jednotlivých opatření dle místa a času realizace. Součástí jsou i mapové přílohy.

• SDO – Ptačí oblast Komárov (PDF, 1 MB)
  Ptačí oblast Komárov byla vymezena nařízením vlády č. 679/2004 Sb. ze dne 8. prosince 2004. Předmětem ochrany této ptačí oblasti jsou zimující populace motáka pilicha (Circus cyaneus) a kalouse pustovky (Asio flammeus) a jejich biotopy.
• SDO – Ptačí oblast Východní Krušné hory (PDF, 34 MB)
  Ptačí oblast Východní Krušné hory byla vymezena nařízením vlády č. 28/2005 Sb. ze dne 15. prosince 2004. Předmětem ochrany této ptačí oblasti je populace tetřívka obecného (Tetrao tetrix) a jeho biotop.
• SDO – Ptačí oblast Novodomské rašeliniště – Kovářská (PDF, 36 MB)
  Ptačí oblast Novodomské rašeliniště – Kovářská byla vymezena nařízením vlády č. 24/2005 Sb. ze dne 15. prosince 2004. Předmětem ochrany této ptačí oblasti jsou populace tetřívka obecného (Tetrao tetrix) a žluny šedé (Picus canus) a jejich biotopy.
• SDO – Ptačí oblast Českolipsko – Dokeské pískovce a mokřady (PDF, 1 MB )
  Ptačí oblast Českolipsko-Dokeské pískovce a mokřady byla vymezena nařízením vlády č. 598/2004 Sb. ze dne 27. října 2004 . Předmětem ochrany této ptačí oblasti jsou populace jeřába popelavého (Grus grus), motáka pochopa (Circus aeruginosus), lelka lesního (Caprimulgus europaeus), skřivana lesního (Lullula arborea) a slavíka modráčka (Luscinia svecica) a jejich biotopy.
  Mapové přílohy (ZIP, 6 MB )
• SDO – Ptačí oblast Soutok – Tvrdonicko (PDF, 2 MB )
  Ptačí oblast Soutok-Tvrdonicko byla vyhlášena nařízením vlády č. 26/2005 Sb. ze dne 15. prosince 2001. Předmětem ochrany jsou populace čápa bílého (Ciconia ciconia), včelojeda lesního (Pernis apivorus), luňáka hnědého (Milvus migrans), luňáka červeného (Milvus milvus), raroha velkého (Falco cherrug), leďnáčka říčního (Alcedo atthis), žluny šedé (Picus canus), strakapouda prostředního (Dendrocopos medius) a lejska bělokrkého (Ficedula albicollis) a jejich biotopy.
• SDO – Ptačí oblast Rožďalovické rybníky (PDF, 3 MB )
  Ptačí oblast Rožďalovické rybníky byla vyhlášena nařízením vlády č. 606/2004 Sb. ze dne 27. října 2004. Předmětem ochrany jsou populace motáka pochopa (Circus aeruginosus) a jeřába popelavého (Grus grus) a jejich biotopy.
• SDO – Ptačí oblast Jaroslavické rybníky (PDF, 913 kB )
  Ptačí oblast (PO) Jaroslavické rybníky byla vyhlášena nařízením vlády č. 603/2004 Sb. ze dne 27. října 2004. Předmětem ochrany této ptačí oblasti je populace kvakoše nočního (Nycticorax nycticorax) a jeho biotop.
• SDO – Ptačí oblast Českobudějovické rybníky (PDF, 1 MB)
  Ptačí oblast Českobudějovické rybníky byla vyhlášena nařízením vlády č. 405/2009 Sb. ze dne 26. října 2009. Předmětem ochrany jsou populace kvakoše nočního (Nycticorax nycticorax), rybáka obecného (Sterna hirundo), slavíka modráčka (Luscinia svecica), husy velké (Anser anser) a kopřivky obecné (Anas strepera) a jejich biotopy.
• SDO – Ptačí oblast Heřmanský stav – Odra – Poolší (PDF, 2 MB)
  Ptačí oblast Heřmanský stav – Odra – Poolší byla vymezena nařízením vlády č. 165/2007 Sb. ze dne 4. června 2007. Předmětem ochrany této ptačí oblasti jsou populace bukáčka malého (Ixobrychus minutus), ledňáčka říčního (Alcedo atthis) a slavíka modráčka (Luscinia svecica) a jejich biotopy.
• SDO – Ptačí oblast Bzenecká Doubrava – Strážnické Pomoraví (PDF, 1 MB)
  Ptačí oblast Bzenecká Doubrava – Strážnické Pomoraví byla vymezena nařízením vlády č. 21/2005 Sb. ze dne 15. prosince 2004. Předmětem ochrany této ptačí oblasti jsou populace čápa bílého (Ciconia ciconia), motáka pochopa (Circus aeruginosus), lelka lesního (Caprimulgus europaeus), strakapouda prostředního (Dendrocopos medius), strakapouda jižního (Dendrocopos syriacus) a skřivana lesního (Lullula arborea) a jejich biotopy.

• NV č. 530/2004 – PO Nádrž vodního díla Nechranice (PDF, 167 kB)
• NV č. 531/2004 – PO Žehuňský rybník-Obora Kněžičky (PDF, 269 kB)
• NV č. 532/2004 – PO Orlické Záhoří (PDF, 167 kB)
• NV č. 533/2004 – PO Libavá (PDF, 223 kB)
• NV č. 534/2004 – PO Podyjí (PDF, 403 kB)
• NV č. 535/2005 – PO Řežabinec (PDF, 223 kB)
• NV č. 598/2004 – PO Českolipsko-Dokeské pískovce a mokřady (PDF, 2 MB)
• NV č. 599/2004 – PO Jeseníky (PDF, 2 MB)
• NV č. 600/2004 – PO Krkonoše (PDF, 2 MB)
• NV č. 601/2004 – PO Lednické rybníky (PDF, 1 MB)

• NV č. 602/2004 – PO Novohradské hory (PDF, 1 MB)
• NV č. 603/2004 – PO Jaroslavické rybníky (PDF, 1 MB)
• NV č. 604/2004 – PO Hovoransko-Čejkovicko (PDF, 2 MB)
• NV č. 605/2004 – PO Jizerské hory (PDF, 2 MB)
• NV č. 606/2004 – PO Rožďalovické rybníky (PDF, 2 MB)
• NV č. 607/2004 – PO Údolí Otavy a Vltavy (PDF, 2 MB)
• NV č. 608/2004 – PO Bohdanečský rybník (PDF, 1 MB)
• NV č. 609/2004 – PO Hlubocké obory (PDF, 2 MB)
• NV č. 679/2004 – PO Komárov (PDF, 1 MB)
• NV č. 680/2004 – PO Třeboňsko (PDF, 2 MB)

• NV č. 681/2004 – PO Šumava (PDF, 1 MB)
• NV č. 682/2004 – PO Pálava (PDF, 1 MB)
• NV č. 683/2004 – PO Labské pískovce (PDF, 1 MB)
• NV č. 684/2004 – PO Křivoklátsko (PDF, 2 MB)
• NV č. 685/2004 – PO Králický Sněžník (PDF, 2 MB)
• NV č. 686/2004 – PO Horní Vsacko (PDF, 1 MB)
• NV č. 687/2004 – PO Beskydy (PDF, 2 MB)
• NV č. 688/2004 – PO Doupovské hory (PDF, 2 MB)
• NV č. 19/2005 – PO Boletice (PDF, 1 MB)
• NV č. 20/2005 – PO Broumovsko (PDF, 1 MB)

• NV č. 21/2005 – PO Bzenecká Doubrava-Strážnické Pomoraví (PDF, 1 MB)
• NV č. 22/2005 – PO Hostýnské vrchy (PDF, 3 MB)
• NV č. 23/2005 – PO Litovelské Pomoraví (PDF, 1 MB)
• NV č. 24/2005 – PO Novodomské rašeliniště-Kovářská (PDF, 1 MB)
• NV č. 25/2005 – PO Poodří (PDF, 1 MB)
• NV č. 26/2005 – PO Soutok-Tvrdonicko (PDF, 1 MB)
• NV č. 27/2005 – PO Střední nádrž vodního díla Nové Mlýny (PDF, 1 MB)
• NV č. 28/2005 – PO Východní Krušné hory (PDF, 1 MB)
• NV č. 165/2007 – PO Heřmanský stav-Odra-Poolší (PDF, 2 MB)
• NV č. 405/2009 – PO Českobudějovické rybníky (PDF, 1009 kB)
• NV č. 406/2009 – PO Dehtář (PDF, 398 kB)